天然黑米是由专用选育的黑稻品种，按照规范水稻种植流程栽种培育后收获得到的，并不是普通大米染色加工而来的。
1、播种育苗
提前挑选适配当地气候、土壤条件的优良黑稻品种，播种前先晒种、用药剂浸泡消毒，催芽露出白尖后，在春季气温稳定回升到12℃以上时播种育秧，日常保持苗床湿润，等到秧苗长出4-5片真叶，就可以移栽到大田了。
2、移栽管理
移栽前提前给大田翻耕整地，施足腐熟有机肥作为底肥，按照合理的密度栽种，生长期间根据不同生育期调整浇水量，分蘖期、孕穗期按需追施磷钾肥，同时做好稻瘟病、稻飞虱等常见病虫害的防控，等到稻穗完全成熟、谷粒全部变为深黑色后就可以收割脱粒，得到黑米。
3、二者的种植差异
黑稻和普通白稻的种植流程大致相近，但核心区别很明显：首先品种不同，黑米必须用专门选育的黑稻品种才能种出天然有色黑米，普通大米属于常规白稻品种；其次种植要求更高，黑米对土壤有机质含量、光照条件的要求比多数普通大米更高，种植过程中有机肥占比也更高，才能保证黑米的色泽和营养含量；最后生长周期更长，大部分黑米品种的生育期比普通常规大米长10-15天左右，成熟收获的时间也更晚。