大量香菜可通过冷冻、腌渍、阴干三种方法长期保存，储存得当能放1-6个月不变质。
A 冷冻储存法：先剔除烂叶、老根，抖掉香菜表面的浮土，分成每次能吃完的小份，装进密封保鲜袋后挤掉袋内多余空气，扎紧袋口直接放入冰箱冷冻层即可。这种方法保存的香菜香味流失少，吃的时候无需化冻，随取随用，储存得当能放3个月左右。
B 干制腌渍储存法：适合家里冰箱冷冻空间不足的情况，可以把香菜整枝挂在通风避光的地方阴干脱水，完全干透后装进密封罐，能放半年以上，炖汤增香效果很好；也可以把香菜切碎加食盐拌匀，装进无水无油的玻璃罐密封放阴凉处，腌渍保存能放1个月左右。
C 关于保存香菜要不要洗：保存前一定不要洗。香菜沾水后如果没完全擦干，储存过程中很容易发霉腐烂，加速变质。如果香菜带的泥沙太多，可以用干刷轻轻刷掉浮土，等要吃之前再清洗即可，一定要提前处理的话，必须把表面水分彻底擦干再储存。
储存香菜前一定要先挑出已经腐烂、发软的坏香菜，避免坏叶带菌污染好的香菜，缩短整体保存时间。