新鲜银耳需根据计划食用的时长选择对应保存方法，做好控水控温即可避免快速变质。
1、短期存放选冷藏，适合一周内吃完的情况：新鲜银耳不要提前清洗，先摘除发黄、破损的部分，用干净厨房纸包裹吸走表面多余水汽，装入扎了3-5个透气小孔的保鲜袋，放到冰箱2-4℃的冷藏层，这种条件下新鲜银耳可以存放5-7天。
2、长期存放选冷冻，适合一个月以上不食用的情况：把新鲜银耳分成每次能吃完的小份，分别用保鲜袋密封排出袋内空气，直接放入冰箱冷冻层，零下18℃的环境下可以存放3个月左右，吃之前提前放到冷藏室解冻即可，口感不会有明显变化。
3、无冷冻条件可选晾晒保存：将新鲜银耳逐朵摆放在透气的筛网上，放到通风向阳的位置晾晒3-5天，完全干透后装入密封罐，放在阴凉干燥处存放，可以保存半年以上。
新鲜银耳本身含水量很高，非常容易滋生霉菌变质，一旦发现有发黏、发酸、长霉斑的情况，要直接丢弃，不可继续食用。