处理干净红色石斑鱼，只需要依次去除脏污部位、刮鳞搓掉黏液、泡净血水即可。
1、先摘除不可食用部位：先找到鱼鳃位置，用剪刀剪断鱼鳃两侧的连接组织，直接把鱼鳃整个抽出扔掉，再切开鱼腹掏出全部内脏，一定要把鱼腹内壁贴附的黑膜完全刮干净，这里是污染物和腥味的主要来源，摘除的时候要注意别弄破鱼胆，要将鱼胆完整取出扔掉。
2、清理鱼鳞和表面黏液：红色石斑的鱼鳞细密，用刀背逆着鱼鳞生长的方向慢慢刮遍全身，别漏掉鱼鳍、鱼尾附近的细鳞，刮完鱼鳞后抓一大把粗盐涂抹整个鱼身反复搓揉，能把鱼身表面滑腻的有害黏液搓下来，搓完用清水冲掉盐和脱落的杂质。
3、浸泡去除残留血水：把初步处理好的鱼放进浓度5%左右的淡盐水中浸泡10分钟，让鱼肉深层的残留淤血渗出来，泡好后再用流动清水冲一遍就处理完成了；关于红色石斑鱼不能吃的部位，除了上述的鱼鳃、内脏、黑膜、鱼胆，鱼牙也建议剪掉，它自带很重的腥气；如果是两公斤以上的野生红色石斑，头部可能积累少量雪卡毒素，不建议食用鱼头，养殖的红色石斑没有这个问题。
处理红色石斑鱼的时候，黑膜和淤血一定要清理干净，这两步是去除腥气提升口感的关键，处理好的鱼肉不管清蒸还是红烧都能保持原有的鲜甜。