干核桃常温密封放在干燥避光处即可保存，新采青皮核桃需脱青皮晾晒脱水后保存，催芽可采用低温层积或温水浸种两种方法，都能获得较高出芽率。
1、分类做好保存工作：已经晾晒完成的干核桃种子，装入透气编织袋或者干净密封罐，放在5-10℃的干燥避光环境保存即可，每1-2个月取出通风一次，防止发霉返潮；刚采收的新青皮核桃，先剥去外层青皮，放在向阳通风处晾晒3-5天，等到核桃含水量降到12%以下（晃动核桃能听到果仁轻响），再转入干核桃保存流程即可。
2、低温层积催芽（适合大规模春播，出苗整齐）：如果是春播用的核桃种子，可在播种前60-90天开始层积，将保存好的核桃和湿润河沙按照1:3的比例混合，挖深30-40厘米的土坑，填入混合种子后，上方盖10厘米厚的湿润沙土，再盖一层稻草保温，保持温度在0-5℃，播种前一周取出，有一半种子露白即可播种，出苗率能达到90%以上。
3、温水浸种催芽（适合少量种植，操作简单出苗快）：把保存好的核桃放入80℃的温水中，边放边搅拌自然降温，浸泡2-3天，每天更换一次清水，泡好后捞出放在25℃左右的避光环境中保湿，3-5天即可露白播种，比直接播种出苗快7-10天，很适合家庭少量种植操作。
保存核桃一定要先充分脱水，催芽过程中发现腐烂坏种要及时挑出，避免污染健康种子影响出芽。