新鲜百合最好密封低温保存，根据食用时间的不同，也可以选择沙土干藏，都能有效延长新鲜百合的存放时间。
1、短期保存选冷藏：如果1-2周内就要吃，保存前先摘掉发黑腐烂的坏瓣，不用水洗，沥干表面水分后装入带少量透气孔的保鲜袋，放入冰箱冷藏室即可，能最大程度保留脆嫩口感。
2、长期保存选冷冻或沙土干藏：一次买了很多吃不完，可以把百合处理干净掰成小瓣，焯水1分钟捞出过凉水，沥干后装密封袋放冷冻层，能存半年左右；没处理的整颗百合可以埋进干燥通风的细沙土中，能放1-2个月。
3、新鲜百合放冰箱的存放时长：密封状态下放冰箱冷藏，能放1-2周；如果已经焯水处理好放入冷冻层，只要不反复化冰冻融，能存放3-6个月，一般不会变质变味。
保存新鲜百合时要注意，存放前一定要挑出坏瓣，带生水存放很容易提前发霉，吃之前先检查，一旦有发霉发软的情况就不要食用了。