1、凝聚剂不同：卤水豆腐是用结晶氯化镁水溶液点制的，也被称作叫盐卤豆腐，主要是因为结晶氯化镁水溶液俗称盐卤；而石膏豆腐是用硫酸钙化成的石膏水点制的，除了卤水和石膏之外，葡萄糖酸内酯、柠檬酸等都可以用来点制豆腐。
2、口感味道不同：卤水豆腐的口感偏于绵韧，吃起来感觉比较硬，含水量较少，卤水豆腐吃起来有豆香味，颜色看上去白中略偏黄，质地比较粗老，俗称“老豆腐”、“北豆腐”；而石膏豆腐的口感较细嫩，也比较光滑，比卤水豆腐要软嫩许多，但豆香味比较淡，含水量多，从颜色上来看，石膏豆腐色泽洁白，比卤水豆腐要白一些，俗称“嫩豆腐”、“南豆腐”。
3、吃法不同：卤水豆腐豆香浓郁、筋道有嚼头，适合用于煎、炸、酿以及制馅等；而石膏豆腐豆香味淡、切和翻炒时易碎，适合用于做拌、烩、烧、制作汤、羹菜肴。