1、果实堆沤，银杏果实采收之后，应尽快脱去浆汁外种皮。脱皮愈快，银杏种核的色泽愈好。银杏果实采回后，要先将果实堆沤，让其果皮充分腐熟。堆积地点尽量选在背阴之处。堆积时可平堆也可高堆。平堆高度以40—50厘米为宜。上面用湿草覆盖，不宜用塑料布薄膜。经5-7天即可开堆进行脱皮处理。经验证明，平堆散热快，脱出的种核洁白漂亮，但腐熟时间较高堆略长。堆积腐熟时切忌暴晒或薄膜覆盖，以防种核变色种仁变质。
2、果实踩搓，待白果果皮充分腐熟后，应穿上胶鞋，在果实堆沤处直接反复踩搓果实，将腐熟的果皮彻底踩搓使其与果核（白果籽）分离。
3、水选漂去果皮，在水池或流动的河水中，用筛子或其它透水性好的塑料框将果皮漂去；将分离出来的果实放入竹筐中用木杵轻捣，再装入筛子或塑料框中，在水中进行第二次漂洗。
4、果实踩搓与提纯，第二次漂洗后的果核，要再倒进竹框中，用脚人工反复踩搓，直至果实上的内果皮全部脱落，然后在水中进行第三次漂洗，最后去掉破果、小石块、果柄等杂质。
5、果实干燥，脱皮处理后的银杏种核即为商品银杏，俗称白果。为保证其安全贮运，应适度干燥。干燥的方法多用晒干或阴干，但以阴干的效果最好。采用晒干方法时，待银杏种核的核皮呈银白色，含水量达40%左右时即可收起放入袋中干藏。干燥时应严禁采用烘箱或烘室干燥，也不要长时间暴晒。