1、两者主要功能不同。C盘是程序运行的主要盘符，除C盘之外的其它盘都可以进行软件安装盘，或者是专文件存储盘，C盘一般属是默认的系统盘，电脑的操作系统一般默认是安装在这个盘上的，这个盘必须是主分区。D盘一般是为方便管理，由除去C盘的空间分割成的，根据硬盘空间总量的大小，规划各分区的大小进行分割，理论上可以分成N个，按照字母顺序往下面排。
2、两者重要性不同。大部分C盘内文件主要由Documents and Settings、Windows、Program Files等系统文件夹组成，Program Files文件夹一般都是安装软件的默认位置，但是也是病毒的位置，所以要对C盘进行严密保护。C盘对于本地硬盘的单操作系统来说，是极其重要的，所以平时存放数据尽量不要放C盘。D盘是指除开划出的C盘并且建立扩展分区之后，在扩展分区内，再建立出来的若干个逻辑分区之一，包括其他的E盘、F盘，都只是它们所在硬盘分区的名字而已，并没有特别的意思。它们主要是为了区分开不同区域的作用以及存储的内容。