1、芝麻收获脱粒晒干去杂后，应妥善贮藏。为保证种子安全贮藏，种子含水量必须小于7%。种子入库前，应清洁仓库环境，消灭仓库虫害、寄生菌类及鼠害；种子应风干去杂，去掉易吸潮杂物；贮藏地点必须通风干燥，下面需有隔潮物垫底。
2、贮藏方法可分包装、囤装和罐装3种。包装采用化纤品或塑料薄膜双层黏合的特制防潮物，它既可以控制温、湿度，又便于运输；囤装要在囤的上下或周围内侧加塑料薄膜密封层，囤必须设置内径30厘米左右竹编散热筒，并用塑料薄膜镶好外径；罐装多为群众留种使用，可以防湿、防鼠、不生虫、不霉变，贮藏效果较好。科研单位因所用育种材料量少，也有用无水氯化钙或硅胶做干燥剂在玻璃干燥器内保存的。