1、虹吸式。
虹吸式马桶又分为两种，一种是旋涡式虹吸，另一种是喷射式虹吸，其内部管道形状是倒“S”状的，具有很强的排污能力，市面上绝大多数的马桶都是采用虹吸式的，尤其是连体马桶。
（1）旋涡式虹吸。
旋涡式虹吸马桶的冲水口是在马桶底部的，冲水的时候水流会形成漩涡，加大了水流和虹吸作用的吸力，能将马桶内的脏物排出。
（2）喷射式虹吸。
喷射式虹吸马桶底部多了个喷射副道，冲水时，一部分水是从布水孔流出，另一部分是从喷射口喷出，借助了水流的冲力，将污物冲走。
（3）优点。
虹吸式马桶冲水噪音小，冲污能力较强，很容易将马桶表面的污物冲走，其防臭效果也更优于直冲式，市面上虹吸式马桶的品种较多，因此选择性多。
（4）缺点。
虹吸式马桶的防水位较高，要有一定的水量才能将污物冲走，每次用水量在8－9升，比较废水，虹吸式的排水管径只有56公分左右，冲水时比较容易堵塞。
2、直冲式。
直冲式马桶的池壁比较陡，存水面积比较小，冲污效率高，是利用被压缩的空气形成推力，将污物排出；但是直冲式马桶使用的是水流瞬间强大的功能，冲击管壁的声音很大，不过直冲式马桶水管直径比较大，容易冲走较大的赃物，市面上后排水的马桶多为直冲式的。
（1）优点。
直冲式马桶冲水管路比较简单，冲水时间也比较短，能够迅速的将污物排走，直冲式马桶的冲污能力上与虹吸式马桶相比的话，直冲式的容易冲下较大污物，比较不容易造成堵塞，而且也比较节水。
（2）缺点。
直冲式马桶噪音比较大，防臭功能不如虹吸式，而且由于管径存水量小，容易出现结垢现象。