1、化学成分不一样
从本质上来区分两者，玛瑙和玉石的化学成分不一样，玛瑙是属于矿物宝石一种，它的主要化学成分是二氧化硅，俗称石英，玉石的主要化学成分是含有水的钙镁硅酸盐，从化学成分上来看两者的本质是有差别的。
2、颜色不一样
这两种玉石的颜色上来看也有不同，但同样颜色的种类会比较丰富，玛瑙会有红色的玛瑙等种类，同时呈现为半透明与不透明的状态，同时玛瑙比玉石多了同心圆的纹路。然而玉石大多是金属颜色，有一定的光泽，比玛瑙透明些。
3、质地也不同
两者从品质方面来看的，都是有好有坏，玛瑙的质地会好些，因为组成玛瑙的颗粒是比较均匀的，颜色方面也是均匀分布，玉石的质地好的相对玛瑙会少一些，玉石的组成颗粒大小不均匀，所以好的质地也不是非常多。