新鲜银杏绝对不能生吃，必须经过脱毒处理、彻底做熟后才能食用，加工制成的银杏成品零食可以直接食用。
1、新鲜银杏食用前先做预处理：剥掉外皮的肉质部分，敲碎硬壳取出种仁，撕掉种仁表面褐色的薄皮，再去掉中间黄绿色的胚芽，把处理好的种仁放入清水中浸泡1到2小时去涩，就可以做熟食用了。
2、银杏炖肉的用法：银杏适合搭配鸭肉、排骨、五花肉这类油润的荤菜，处理好的银杏不要和肉同时下锅，要等肉类快炖好的15到20分钟再下锅，一般一斤肉放10到15颗银杏就够，放太早会把银杏炖得软烂散掉，影响口感。
3、不管是直接烹饪还是炖肉，银杏都必须去芯，也就是去掉胚芽。胚芽里的毒性物质含量最高，哪怕高温炖煮也没法完全分解，不去芯食用很容易引发头晕、恶心等中毒反应。
银杏本身带有微量毒性，成人一天食用银杏不要超过10颗，5岁以下儿童禁止吃银杏，变质银杏要直接丢弃，不要食用。